Agouti ist eine Webplattform zur Unterstützung spezifischer lokaler Projekte.
Die erfassten Säugetier-Sichtungen, sollen die Anzahl und die Verteilung der Arten zeigen.
Dies wird in der Regel von Fachleuten, fortgeschrittenen Naturforschern und ausgebildeten Freiwilligen durchgeführt, die Zugang zu einer Reihe von Kameras haben. Wenn die Kameras nach ENETWILD-Protokollen eingerichtet sind, können die Daten zur systematischen Abschätzung der Säugetierdichte verwendet werden.
Autor: P Palencia/SaBio-IREC
Mithilfe Ihrer Kamerafallenbilder können wir wichtige Fragen über die Populationen von Säugetieren beantworten.
Agouti verwendet eine moderne Benutzeroberfläche, die auf Produktivität ausgerichtet ist. Jeder kann Agouti ohne Vorkenntnisse benutzen. Zur Veranschaulichung der verschiedenen Aspekte des Systems stehen Videos zur Verfügung.
Die App arbeitet mit allen Nutzern zusammen, um die verschiedenen eingehenden Daten effizient zu verwalten.
Die Daten sind in international standardisierten Formaten organisiert und können zu einem späteren Zeitpunkt in offene Archive oder andere Software zur Analyse aufgenommen werden.
Mit der App können Sie Ihr eigenes Team von Mitarbeitern schulen oder mit anderen Forschern zusammenarbeiten.
Unser Wissen über die meisten Säugetiere ist noch recht begrenzt. Obwohl es sehr detaillierte Studien zur Säugetierbiologie gibt, konzentrieren sich die Informationen tendenziell auf sehr kleine Naturräume. Es ist wichtig, diesen sehr lokalen Blickwinkel zu erweitern, damit wir mehr Informationen über bestimmte Säugetiere in ihrer weiteren Umgebung gewinnen können.
Wir werden in der Lage sein, die von Ihnen übermittelten Informationen mit Hilfe von Experten und anderen Mitgliedern der wissenschaftlichen Gemeinschaft zu überprüfen. Diese validierten Informationen werden an ein zentrales Archiv der Global Biodiversity Information Facility (GBIF) und der Europäischen Behörde für Lebensmittelsicherheit (EFSA) gesendet, mit denen Forscher und Wildtiermanager auf der ganzen Welt aktuelle und zukünftige Fragen der Forschung und des Naturschutzes beantworten können.
GBIF – Global Biodiversity Information Facility- ist ein internationales Netzwerk und eine von Regierungen auf der ganzen Welt finanzierte Forschungsstiftung, die darauf abzielt, jedem und überall offenen Zugang zu Daten über alle Arten von Leben auf der Erde zu gewähren.
Ein wichtiger Teil der Mission von GBIF ist die Förderung einer Kultur, in der die Menschen die Vorteile der Veröffentlichung von Open-Access-Daten zur biologischen Vielfalt für sich selbst und die gesamte Weltgemeinschaft erkennen.
Indem Sie Ihre Informationen über GBIF und andere Informationsnetzwerke zur biologischen Vielfalt zugänglich machen, tragen Sie zum globalen Wissen über die biologische Vielfalt und auch zu Lösungen bei, die ihren Erhalt und ihre nachhaltige Nutzung fördern.
Indem Sie Ihre Informationen öffentlich zugänglich machen, können Datensätze aus der ganzen Welt kombiniert werden, so dass Forscher an verwandten Aufgaben mit einem gemeinsamen Ziel zusammenarbeiten können.
Die Europäische Behörde für Lebensmittelsicherheit (EFSA) berät die Europäische Kommission und die breite Öffentlichkeit in wissenschaftlichen Fragen der Lebensmittelsicherheit und der Risiken in der Lebensmittelkette. Die EFSA wird gesammelte Informationen über das Vorkommen und die Verbreitung von Wildsäugetieren nutzen, um das Risiko von Krankheiten zu bewerten, die sich auf Wildtiere, Nutztiere und Menschen auswirken.
Agouti wurde für die einfache Verwaltung und Verarbeitung von Bildern und Daten aus Kamera-Fallenvermessungen entwickelt. Das ultimative Ziel ist es, Daten zu sammeln, Annotationen zu standardisieren und die Daten der breiteren wissenschaftlichen Gemeinschaft zugänglich zu machen. Agouti beherbergt eine Sammlung von Projekten von Organisationen und Einzelpersonen. Projekte sind unterschiedliche Sammlungen von Implementierungen – Serien von Fotos/Videos, die von einer einzigen Kamerafalle an einem einzigen Ort stammen – die ein bestimmtes Vermessungsprotokoll teilen.
Die Projekte werden von Teilnehmern in sechs verschiedenen Rollen bearbeitet. Die höchste Rollenstufe ist Principal Investigator, der die volle Kontrolle über das Projekt hat, und die niedrigste ist Volunteer, der nur Fotos kommentieren kann, die bereits hochgeladen wurden. Ein Benutzer kann in verschiedenen Projekten unterschiedliche Rollen haben. Die Inhalte innerhalb der Projekte sind für Nichtteilnehmer nicht sichtbar. Eigenverantwortung und gemeinsame Entscheidungen liegen auf Projektebene.
Die Projektteilnehmer laden die Daten von ihren Kamerafallen-Speicherkarten hoch und geben den Standort und andere Metadaten manuell ein. Agouti importiert dann die Bilder, zieht Daten, Zeiten und andere Daten aus den Metadaten des Bildes und gruppiert die Bilder anhand der Zeitstempel in Sequenzen, die das gleiche Ereignis darstellen (z.B. ein Tier passiert). Bilder werden durch eine automatisierte Bilderkennung geleitet, um Sequenzen zu identifizieren, die Personen enthalten. Diese Sequenzen sind aus Datenschutzgründen vorgesehen. Die übrigen Sequenzen werden von Analysten inspiziert, die jede mit einer oder mehreren Beobachtungen über eine einfache Schnittstelle kommentieren. Eine Schnittstelle zur Expertenvalidierung ist in Arbeit.
Die Daten können zur Analyse in verschiedene Pakete exportiert werden. Wir stellen Werkzeuge zur Verfügung, um Projektdaten in Grafiken und Tabellen zusammenzufassen. Bilder und Daten werden auf einem Universitätsserver sicher archiviert, gespiegelt und auf zwei unabhängigen und physisch getrennten Rechenzentren gesichert. Links für den Transfer in ein permanentes Archiv – Zenodo – und zu GBIF werden hinzugefügt. Die Projektträger können wählen, ob sie den Wissenschaftlern Daten für die Forschung zur Verfügung stellen wollen.
Das Projekt wird so angelegt, dass alle Daten automatisch zur gemeinsamen Nutzung zur Verfügung gestellt werden können, und wir werden den Beitrag mit GBIF oder EFSA mit einer ausdrücklichen Erklärung auf dem Webportal fördern.
Die Agouti-Schnittstelle zur Kommentierung von Bildsequenzen. Das Formular auf der rechten Seite ermöglicht es dem Analytiker („Spotter“), jeder Bildsequenz eine oder mehrere Beobachtungen hinzuzufügen. Mit dem Schieberegler unter dem Bild können Benutzer durch die Bilder scrollen oder die gesamte Sequenz als Videoclip abspielen.
